店舗の設備等について保健所や消防の指摘を受けている場合、譲渡できるのかの質問です

買手に事前にその事実を伝え、納得してもらった上で造作譲渡契約を行う必要があります。事前の説明なしに契約をした場合、引き渡し後、トラブルになる可能性が高いです。知りながら告げなかった事実については、売主に担保責任が生じますので注意が必要です。